主题：【原创】中日欧非印人类全基因组数据的聚类图 -- 瓦斯

这是一个纯属个人业余好奇所做的事情。

原始数据下载自[URL=ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/hapmap/raw_data/hapmap3_affy6.0/]ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/hapmap/raw_data/hapmap3_affy6.0/[/URL]。压缩文件总计大小约37G。包含中日欧非印等11个人类群体，总人数约1300人。

解压后可以得到每个人的二进制原始数据，每个文件约66M，每个人都有全基因组一百万个位点的基因型数据，总计大小约81G。

这是11个群体的缩写：

ASW African ancestry in Southwest USA

CEU Utah residents with Northern and Western European ancestry from the CEPH collection

CHB Han Chinese in Beijing, China

CHD Chinese in Metropolitan Denver, Colorado

GIH Gujarati Indians in Houston, Texas

JPT Japanese in Tokyo, Japan

LWK Luhya in Webuye, Kenya

MEX Mexican ancestry in Los Angeles, California

MKK Maasai in Kinyawa, Kenya

TSI Toscans in Italy

YRI Yoruba in Ibadan, Nigeria

本图采用Nature 456, 98-101 (6 November 2008)文中描述的软件制作。

• 【原创】从微观来认识基因的缺失与重复(我的材料)