主题：转基因玉米导致养猪场猪绝育 -- 唵啊吽

内含子剪切是发生在信使RNA(mRNA)水平的事件，所以多影响下游事件，如以mRNA的修饰和稳定性，mRNA为模版的蛋白质表达和其相应功能的发挥；一般不会对mRNA上游的事件（mRNA转录和基因组DNA的稳定）造成影响。

关于你提的几个问题：

1）内含子和外显子是在基因的DNA的序列中“穿插”排列的。

内含子粗分为自剪切内含子和需要辅助才能剪切的内含子两大类。

一部分需要辅助才能剪切的内含子存在与外显子“泾渭分明”的情况，即内含子和外显子交界处具有一些特殊的DNA序列，可以被参与内含子剪切的酶体特异性识别，而发生内含子剪切。其余的需辅助剪切的内含子主要编码tRNA，也需要特定的酶识别才能进行。

对于自剪切的内含子，要求内含子部分能够形成特定的分子结构。编码蛋白质的序列很难形成这样的结构，就如同我们把中文小说上的一段话拿出来变成拼音，正好能变成一首英文诗一样。所以转cDNA（见下）导致内含子剪切发生的几率是非常低的。

2）基因工程操作（科研和应用）中所“转”的基因序列绝大部分都是不含有内含子的cDNA序列（除了做内含子研究或者非要给自己找麻烦的人）。cDNA序列是由成熟的mRNA（经过了内含子剪切、加5’帽子和3'尾巴之后）反转录来的DNA序列，直接对应于表达蛋白的氨基酸序列，是不含有内含子的。

3）这个问题不太好回答。现在从实验上，我们可以先通过对解读成熟mRNA和cDNA的序列获知外显子的信息，然后将这些外显子序列放回到基因组DNA序列中去，把一个基因的外显子之间的部分称为内含子区。如果只知道DNA序列没有mRNA的信息，我们只能通过已有的经验进行一些预测，比如上面所说的“泾渭分明”的序列，一些能够造成自剪切的序列结构等等。但预测的结果还是需要实验验证的，也曾在一些内含子区中发现新基因的情况。但我们现在不知道是什么决定了内含子和外显子。

“物理特征”这个概念在生物中不常用，不知道你所指的具体是什么。

4）基因的表达与否受多种因素调控，一个基因即使在整个细胞周期中不表达，也还是被称为基因的。

我们常说的基因由内含子、外显子和一些调控原件组成，所以内含子和外显子是基因之下的概念，不存在哪些基因是内含子或外显子，以及相应机制的问题。

基因的表达是指包含所有内含子和外显子的整个区域被转录为mRNA前体，这个转录过程不会中止在某个具体位置的内含子或外显子，而是受控完成完整的转录后，中止于整个基因编码区的结束位置。

候教方家