五千年(敝帚自珍)

主题:【原创】死亡起源 The Origin of Death -- az09

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家园 谢谢指正

谢谢您的问题,您这个问题问倒我了,呵呵。

我想了想,一时还真不知道如何回答。不过我知道,我的“三进制”的说法是有问题的。

我提到的所谓的三进制,是因为DNA或者mRNA是以三个碱基为一组编码的,但是,我们的碱基实际上有4种,说它是由3位4进制代码编码的,可能还准确一些。3位的4进制代码,它可以编出64种排列(4进制的333 = 十进制的63,它可以表示从0-63种编码),除掉3个“终止密码”外(其实还有一个“起始密码”),还有61种。我们的转运RNA (tRNA) 在携带氨基酸,合成蛋白质的时候,每种tRNA 也是只通过三个碱基来确定某个氨基酸的。不过,我们的氨基酸只有20种,对应61个编码后,这些编码是有冗余的,有所谓的遗传密码的简并性(degeneracy), 我们会发现有多种不同的tRNA对应同一种氨基酸的情形.........

所以,细究起来,还挺复杂。呵呵。 如果您同意我的说法,我将原文改为“简并过的3位4进制编码”,这样应该会准确一些。 谢谢指正。

2016-04-06

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后来再想了想这个问题,似乎还不对,3位四进制是在DNA层面上的,如果在蛋白质层面上,似乎说它们是20进制更合适一些,毕竟有20种氨基酸.........再想想,好像20进制也有哪里不对,好像不是这样算的........已经开始糊涂了,呵呵。

另外,为什么DNA的编码要出现这样的冗余,61种排列只对应20种氨基酸?它们只是冗余而已吗?这种冗余的编码,有没有其他的用途呢?据说这些冗余编码,并非冗余,2012年3 月加州大学在《自然》的一篇报道说,它们可能和蛋白质的合成速度相关。链接出处 (By measuring the rate of protein production in bacteria, the team discovered that slight genetic alterations could have a dramatic effect. This was true even for seemingly insignificant genetic changes known as “silent mutations,” which swap out a single DNA letter without changing the ultimate gene product. To their surprise, the scientists found these changes can slow the protein production process to one-tenth of its normal speed or less.)也就是说,如果把细菌的某个氨基酸代码换成另外一个等位的可以表达同一种氨基酸的代码,蛋白质的合成速度可能会降低到1/10.

如果这些冗余有其他的用途,那在数学上那个又该如何分析呢?

河里藏龙卧虎,相信一定有数学好的河友可以说清楚这个话题。呵呵

2016-04-10

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