主题:Mar.14 Nextstrain上COVID-19解读 -- 陈王奋起
gisaid的基因图上,中国是明显的原发地。但是不知道gisaid的数据是不是经过了筛选的,之前世卫组织一直在说有些发达国家不愿意分析病患的相关信息,我看说的就是美国。
但是换了一个图型以后就明显能看出欧洲的病毒基因族群跟中国的没多大关系,欧洲的基本上是独成一体的三大族群(上半球浅蓝、浅绿、浅黄的那几支),而且基因的族群代际从树杈来观察几乎直通始祖代际。而美国的那支主要族群(左半球中部红色那一支)看起来跟中国(下半球深蓝色那一群)左边的那一支有关系,但是细看连接线就会发现中美两个颜色在基因树杈上是并列的,说明跟中国的关系也不大,只不过其基因代际相对比较年轻。
为啥在图中美国的基因族群看起来是比较新的,我估计跟美国的样本数量偏少有关。有可能美国传上来的数据是经过了筛选的,更接近始祖型的数据隐藏不报。近段时间美国的病毒检测速度表现极差,会不会是很多检测人员都被调派去搞基因检测和筛选去了,所谓的病毒检测盒有缺陷只是个人手不足的借口?否则不管不顾地上传数据,直接就会暴露美国才是病毒原发地的事实真相。
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🙂提醒一下,双击上面的线条可以放大图谱进一步观察分叉的情况 6 逍遥蜀客 字372 2020-03-14 02:28:08
🙂中国今天疑似新增为0了,应该把所有外部传入的归结于输出国 5 做回自己 字69 2020-03-14 00:54:02
🙂还有 3 葡萄 字21 2020-03-14 02:29:48
🙂我去,换了个图型以后发现,欧洲的明显跟中国没关系
🙂美国可能早的就没测 1 桥上 字0 2020-03-14 13:18:22
🙂我觉得可能性是有的,前期美国的检测速度很让人怀疑其检测人 1 逍遥蜀客 字129 2020-03-15 00:06:53
🙂这些序列是谁上传的? 3 有型的马里昂 字443 2020-03-13 22:04:21
🙂这些数据是科研机构自发上传的 2 陈王奋起 字84 2020-03-14 00:18:04