主题:【原创】留学生活杂记 -- 熊猫
如果正好从你需要的序列中间断掉呢?如果断的很乱呢?如果你不计成本自然可以来那么做,但是如果只是实验过程中的一小部分,我觉得还不如直接用其他保存剂保存算了。
我们做一个生物的co1的时候就出现这种问题。线粒体dna啊,量那么大。长度只有700bp,也不算长。
这个虫子的dna含量很高,但是都碎掉了。提取完后一做pcr,结果发现根本没有p出来所要的序列,得到的结果是一片亮光,而不是其他种类那样整齐的带。师兄就说估计是断掉了,dna分解所致。
后来我们又重复好几次,结果都是同样的结果。这个虫子同属的其他虫子的结果都挺好的。只有这一个,是这样的结果。我们就猜可能是这个虫子体内有酒精不能抑制的dna降解酶。当然这只是一种可能。
于是我们采用了液氮现场冷冻的做法,终于把这个虫子的co1序列给p出来了。
这个虫子在中国近海桡足类中占的地位还蛮重要的,近岸以及远海,整个西太平洋都很常见的种类。你所说的做甲酰化的其他技术方法我不懂,但是如果有的话,我师兄一定也想到了。可是我们都没有采用这种方法。我的主要工作是提供样品,鉴定依据,我师兄是分子,我是上游他是下游。具体的一些技术细节我不懂。
我们过些时间打算做一个不同保存剂在保存dna方面的效果的比较。现在还没有开始做。
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🙂哥们你这ID不知道还有多少人记得 1 老余 字20 2010-12-27 00:01:39
🙂你得看你的目的是什么啊 3 方解石 字558 2010-12-14 19:11:41
🙂测序本身就是在拼啊 1 喜欢喝冰茶 字184 2010-12-14 17:42:00
🙂晕死,你要的序列是多长不考虑吗
🙂你所说的是基因组组装 1 喜欢喝冰茶 字294 2010-12-14 20:17:46
🙂晕倒了,我们说的不是一个东西啊~~~~ 方解石 字0 2010-12-14 21:55:03
🙂呵呵,测序本身除了新物种的基因组 1 喜欢喝冰茶 字463 2010-12-15 06:17:40
🙂恩,第三代的技术我的确不清楚 1 方解石 字316 2010-12-15 16:25:56