五千年(敝帚自珍)

主题:【整理】老鼠不见了 谁动了它们的基因?——山西、吉林 -- 司徒摘杏

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家园 中国批准的转基因水稻是中国人自己搞的。

  不是买美国的。

  在此之前,中国买美国的食品并不少,七十年代每年进口几百万吨小麦。

家园 不能这么算

玉米基因组中有很多repeat elements,用next generation sequencing完成测序后,短reads的组装会非常困难

家园 昨晚刚好到一农户家里吃饭

谈起今年收成,一农民说今年老鼠特多!我特意问了是不是老鼠近年是不是变小了?他说没啥变化就是今年数量多专咬禾杆---一兜禾就没了基本。

我家里也种稻谷,直播最怕就是老鼠和杂草。

家园 谢谢指正

我所说的是利用next generation sequencing找出目的基因组中的外源片段,没有必要把所有的reads组装起来,现在Roche的Read达到400bp,应该够长了.

家园 这个你想当然了

玉米水稻的全基因测序比拟南芥困难的多得多,或者换过来说更合适,拟南芥的全基因组测序比玉米水稻容易的多的多。容易来自两方面

1.拟南芥基因组尺寸小结构紧凑,测序工作量小很多。这也是为什么它是第一个搞全基因测序的,容易啊。

2.拟南芥的全基因组数据已经有了,你说的3000刀两周,其实是高通量测很多基因组的片段以后,再根据比对已知的基因组数据去拼装那些片段。而玉米水稻的基因组信息不全,gap非常多,这意味着你无法做比对了,拼装难度大多了。玉米在这点上,比水稻的困难还要大。此外植物基因组里面重复序列非常多,这是现在高通量测序技术的大敌。序列一样的短片段,你怎么知道往哪里装。玉米我不清楚,水稻的重复序列出现频率比拟南芥高不少,而且重复序列还长。测序的难度增加很多。我估计在这个问题上,玉米不会比拟南芥难度低。

很多鉴定转基因作物的技术,原理上非常简单。不就是PCR,最多巢式PCR,然后测序。其实操作起来,讲究还是不少的。否则国家也没必要搞什么转基因安全国家实验室了,直接给卫生局什么的配几台PCR仪就行了

家园 400不算长

我知道国内好多家都在等那个号称能测1K的Pacific

家园 我反推,为什么转基因这么好,杜帮为什么大大方方 承认?

从理论上,可以算转基因吧。为什么不大大方方承认,并且证明转基因无害呢

家园 造谣以后还让别人承认?

从理论上算转基因,从哪里扯的?按照这个说法,杂交也叫转基因。

是就是,不是就是不是。

我是不是也可以推一下,阁下如此推导,是不是拿了钱了?

家园 中国自己的更不能相信了

看看三鹿,还能相信么?

我觉得有些人,像我们小时候的事,闭上眼睛说:不听不听,王八念经。

家园 绝大部分不还是孟山都系的,具体可看看急着推广的那些东西

完全中国人自己搞的,还真不多见,国人自己搞的最多的还是杂交品种吧

家园 你给个证明说这两种水稻是孟山都的?

  有个事实是中国现在种的转基因棉花,绝大部分,好象是百分之九十几吧,是中国人自己的。

家园 有什么奇怪么?

中国现在平均二十多年才能生育下一代,老鼠繁殖速度是多少?

现在抗生素越来越不管用了,因为细菌繁殖更快。

家园 转基因是好东西嘛!要是有人夸你对朋友很好

尽管你背地里老害朋友,当面你也会点头称是吧?!

家园 这个思路很有趣

有点类似于metagenomic phylogenetic classification,但实际操作起来还是会比较困难,特别是在基因组较大的情况下

另外,和illumina以及ABI SOLiD比起来,454的测序深度太浅,而且sequencing的时候容易出现short indels error,并不是re-sequencing的合适选择

家园 你提到的胡温在深圳的讲话是什么?可以给个连接吗?

杜邦先锋是谁主持引进的?

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