五千年(敝帚自珍)

主题:【文摘】复旦26岁研究生破“基因天书”密码 震惊世界 -- Melon

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家园 你们做siRNA的knockdown能到多少?

达到90%以上knockdown的siRNA不好找啊。

家园 写的好清楚

连我这外行看完了都自以为看懂了,呵呵。

献朵花。

家园 难说

同一个RNAi,好的能到八十多,差的也就三四十。具体你可以查查 Takeuchi et al., Bruneau BG, Development 132, 2463-2474, 2005

难说
家园 谢!
家园 基因弄清之际,世界大乱之时。。。

总觉得要是我们真的弄清所有基因功能,并且能进行任意操作改变的话,届时世界一定大乱。最初的目的一定是好的,但人类的贪欲永远会让事情向相反的方向发展,任何事物都是双刃剑,只不过比比看哪一面更锋利罢了。觉得庆幸的就是在我有生之年这件事应该还是不会发生的。。。

家园 泼一小点冷水

事先声明,我还没有看过原文,只是根据这篇报道作一点小的评论。

从文章里看,作者发现了一种新的转座子,可以随机(注意是随机)的将目的片断插入小鼠基因组中,从而大规模在基因组中制造突变。这种方法,用他们的话来说可以“更为高效、快速地破解“基因天书””云云。

这里有两个问题。第一,这确实是一种很新的方法,但在这之前已经有了好几种很成熟的,高效产生突变的方法,比如ENU诱变,重组病毒,甚至转基因,第一种产生点突变,后两种和复旦组的方法一样,都是在基因组中随机插入设计的大片段。这些虽然与复旦发现的方法机理不同,但结果是类似的。实际上,在以小鼠作模型的研究中,这几种方法用的越来越少了,其原因就是研究的瓶颈不在确定感兴趣的基因,而是确定基因作用的原理,也就是我想说的下一个问题。

第二个问题,蛋白质的功能性研究。

发现感兴趣的突变后的第一件事情,是确定受影响的是什么样的基因,首先,要对基因定位(mapping)。小鼠的基因组大约有2.5Gb(10 to the 9th)个碱基对,而突变影响的只是其中很小的一部分,所以,这个就像是海底捞针的。于是就要做很多的mating,根据已知的genetic marker,做linkage analysis,缩小到一个小片段,这可是很大的工作量,mating做的越多,确定的片段越小。确定后,根据小鼠基因组的序列确定这个片段中编码的基因,一般有几十上百吧,根据基因的expression pattern, predicted strucure等等各种各样的信息,推测那些是最有可能的candidate gene,然后再进行序列分析(可以做什么 PCR, sequencing, sscp, denaturing hplc...,吐血ing,太多了,,大家也看不下去了,我也写不下去了)最终确定受影响的那个基因。

太长了,先发这一部分,待会在接着写

to be continued

元宝推荐:ArKrXe,
家园 什么叫"knock-out"?

和电子游戏中的KO有什么联系? 嘿嘿.

还有"microarray"?

老板文章上带没带火焰的名字啊? 恭喜恭喜.

家园 knock out

把基因组中目的基因的序列删除或者用其他序列代替的技术。这样目的基因就不会表达,所以就可以知道这个基因在体内的作用。

家园 KO可以控制位点,他们的不可以
家园 反过来叫knock in

可以让目的基因在你想要的时间和地点表达

比如,让GFP在小鼠眼睛里表达,就可以造出绿眼睛的耗子

点看全图

外链图片需谨慎,可能会被源头改

家园 GFP是什么?图片是真的吗?

 第一反应:妖孽

家园 GFP 绿色荧光蛋白

图片当然是真的了。其实这样的老鼠很多的,红黄蓝绿紫都有,五颜六色。而且可以选择在各种地方表达,什么地方发光的都有。

再找几张

点看全图

外链图片需谨慎,可能会被源头改

还有,发绿光和不发绿光的老鼠对比

点看全图

外链图片需谨慎,可能会被源头改

家园 你们做生物的果然是强,佩服佩服

 面对这样的老鼠,一定有和上帝分享造物乐趣的感觉。

家园 嘻嘻,下次可以作一只绿狼

或者作一只"黄" "鼠" 狼

家园 将要发的原文在这里

http://download.cell.com/pdfs/0092-8674/PIIS0092867405007075.pdf

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