主题：【原创】你凭什么让我们的祖宗东奔西走颠簸流离 -- 老顽童
家园 【原创】你凭什么让我们的祖宗东奔西走颠簸流离 如今有个很有意思的花钱去处，你只要寄一百刀给美国的一个什么公司，并附上血样，他就可以给你一条你的祖宗迁徙线路图。如你老祖原先在那，后又到那，几千年前到高加索，过了多少年又来中国，一千几百年前又到了日本……
凭什么？
我知道是由基因DNA呀，什么变异的确定的，但我们外行人还是茫然，变异在什么位置？是突变还是周期性的？为什么？……？
有请河内高手来释疑，最好不要做学术报告，就当给少年儿童科普。
先谢了。
又：《砂锅斋》开业了，有数个高阶位置等人来坐，欢迎申请。事先声明：来者一是要遵守河规。二是有责任，无报酬（若今后西河做大鸟，铁手发大财鸟，另当别论，我会替弟兄们讨公道滴）。
河友们有空多来玩阿
家园 我觉得有点危险，赔钱还要免费送上自己的DNA样本。 家园 在CBS的60minutes里看到了 介绍，好像就是上个礼拜天晚上（12月9号）的
技术的问题没怎么介绍，反正介绍了某也不懂
不过好像查到不是血液，是用个什么东西漱口，然后把那个漱口水寄回去，还有个棉签左右在牙齿上弄弄什么的
公司的背景（宗教背景？或者说政治背景？）很好玩。
公司的老板是个evangelical，福音派信徒，呵呵美国目前即便不是最powerful的宗教团体，也差不离了
他们这个技术研讨，仿佛是基于这样一种良好的愿望：通过基因技术，可以发现世界上任何两个人的亲缘关系。
世界大同的生物学基础啊当时主持人还问了个问题，仿佛是是不是一个3K党党徒通过图谱最后会发现自己跟很多黑人是亲戚呢
呵呵，生物学上肯定是没问题的。不过社会学意义上，某很怀疑一个发现自己跟黑人有亲戚关系的3K党徒会从此对黑人亲善起来
当然这个技术还是很还玩的，很能安慰大伙。
主持人是个印度裔，好像就没怎么回过印度。一测，哈哈，那就看到跟自己related的人们在哪里哪里，很有归属感。
还访问了一个从小被人收养的中农白人男，他没有任何关于收养前的信息，连以前的名字都不知道。
一查，他上中学的时候，隔壁班有个人跟他血缘上类似cousin。的确是心灵的安慰啊。
呵呵，这个公司貌似超级有钱，正在蒙古国采样呢。
呵呵，看在evangelical的份上，我家这几百美刀，是一定要自个留着的
家园 有意思。想起软件上的相似性算法来了 比如在WIKI里，就有一个功能，是比较前一次修改和现在版本差异的。具体的算法，我也没明白
。考虑一下，如果把所有染色体里的DNA的每个编码，A、T、C、G当作是文本，一个人的所有DNA序列就是一个巨大的文本，用一些超级计算机来比较两个人之间的序列相似性，应该也还可行，虽然速度会比较够呛一些。
现在对基因的东西不熟悉了。我有个疑问，比如一条染色体当中的基因序列，它是不是总是在某一个位置，或者说是在某一个位置附近，还是可以在染色体的任意位置，只是靠某些特殊的标记来表明这段代码是某个基因？
这个公司什么算法不知道。我想大概有两种可能，一种就是纯粹的看DNA序列，不去考虑基因组。另外一种可能，就是分析分类所有的基因组，变异的也好，不表达的也好，片段也好，最后得到一个总的数据库。假设，这个基因组数据库中总共有一百万个基因组。再假设甲有其中的40万个基因组，乙有其中的30万个基因组。比较甲乙之间基因组的重复程度，就可以判断两个人来源的相似性。
不过，对这种技术，我是有些担心的。
家园 在一个物种力，一般来说，一个基因有一个基因的固定位置 叫做它的座位（locus），物理上就是在一个特定的染色体上的特定位置，是不会怎么大动的。（一个染色单体就像一个线性的存储器，除了结构相关的部分，就是线性的信息序列）。每个人有23对染色体，每对都是父亲给一条dna母亲给一条dna，精子和卵子形成的时候，来自父母双方的dna会并到一起，随机交换相应的位置。因为相同的基因一般在相同的座位上，所以原地一换，每条dna上就携带了来自父母的基因的不同组合，而这些组合又组成一整套必须的人类基因组。这是造成龙生九子，九子不同的主要原因。
在一些物种里，也发现有少数的dna片段在整个基因组里到处跳，这叫转座子。不过在高等生物里，那个好像一般不看作正常的成分，而是当作病毒一类东西看待。研究遗传的时候，用的基因都是在比较稳定的位置上，而且不是可有可无，可多可少的那种。
另外，好像您对基因组的理解不大对。一个基因组，genome，就是一个个体的整套基因的集合，没有人会有40万个基因组的，呵呵。比如说，酵母的基因组大概有6000个基因，人的我忘了，好像10万个基因左右。
这些人做亲缘分析，一般也就取大家都有的一段必须基因，比如核糖体rna基因，或者什么代谢必须的酶的基因，或者什么都不编码，但是大家都有的片段，测个序列，一般都测上几千到几万碱基对（一个碱基对的信息量是2bit），然后跟来自别的个体的同一片段的序列对比，建立相似树，根据这个相似性来说您郡望何处。从这个公司100美元的收费看，估计也就给你做两三个测序反应(通常的技术，一个反应最多读1千碱基对)，这个成本估计20块左右，然后给你比对序列的差异，也就是看这两三千个碱基对（2×bp bit的信息量）携带的差异。其实这么点信息量，又是光取样有限的几个小区域，未必能准。另取别的一段基因，也许结论就大不相同。反正您也没地方查去，图个乐呗。
此外他们的模型可能是亲缘树，也就是假设人的祖先很少交叉，总是分叉，是一个树状结构。但是我们都知道，如果没有生殖隔离的话，人的亲缘关系肯定是网状的，不是树状的，因为人是有性生殖的，不是分裂生殖的。所以他们这个结果看看玩玩也就可以了，不能太当真。
其实别说精确到人，就算精确到整个人类的系统发生，还很值得探讨呢，一会说人的祖宗是露西，一会又来什么非洲古人兵分两路。现在的主要问题是测一个人的基因组是要花很多钱很多时间的，短期内还不可能迅速的把一个人的整个基因组给测序，就算测几十分之一，几百分之一都搞不起，往往只能像上面说的那样，测很小的一段，所以每个样本的信息本身就是片面的。整个人类基因组计划，好像也就几十个人的样本吧。哪天能说揪出一个人来，立马就能把他哪条染色体的全序列拿出来，那样，人类的医学就该革命了。另一方面，世界上有60多亿人，就算每个人按现在的水平那样只测一小段，就测一下，要把每个地球人全测了也不可能。就算用抽样的办法，也还是搞不起，肯定有很严重的漏网现象。用这样的数据搞统计，就是用有限的墨水画大画，看到的现象是真的还是假的，在有更全面的统计结果前，谁也说不清。而现在的条件还就是这样，所以那些结论肯定会不断的被新结果修正的。
家园 好文好文。才知道同一组染色体相互之间也可以交换基因 以前还以为在同一组染色体中的两个染色体上的基因也就是显性，隐性的关系，才知道他们之间也是可以相互交换基因的。这么做，对进化机制的实现很是有利。这种交换是在受精的时候立刻就进行了么？还是在细胞分裂的时候进行的？
家园 这个交换是在精子和卵子形成的过程里发生的 精原细胞和卵原细胞都是2倍体，它们经过减数分裂变成单倍体的精子和卵子，减数分裂是由两次细胞分裂组成的，染色体配对，交换片断是在第一次分裂里发生。这时候精子和卵子还在还没见面哪。
受精之后，精子卵子形成合子，然后由这一个合子开始，形成新的个体。除了开头的几次分裂（叫卵裂）之外，在高等生物胚胎发育的过程里的分裂叫做有丝分裂。在一个人的成长过程中，除了生殖细胞进行有丝分裂外，其它的细胞分裂都是有丝分裂。在有丝分裂里，虽然也存在类似于减数分裂里的dna片段交换，但是这种事件发生得非常稀少，所以一个动物的绝大部分体细胞基因型是差不多的。
而动物的生殖细胞就不同了，首先，在形成精子和卵子的过程里，光是靠随机选取来自父母的染色体的组合，就有2的23次方（8M）种可能，再加上前面说的减数分裂里的基因交换，这个数字就没法算了，非常的大。所以人的生殖细胞，基因型很可能个个都不一样。
假如没有这个dna片段的交换，染色体都原封不动的放进配子里，那么很明显，后代的多样性就直接受制于染色体的对数：人是23对，可以产生2^23=8M种配子，那狗有39对，就可以产生0.5T种配子，加上人家一窝生5，6个，那理论上狗比人进化的可是快多了。所以为了公平起见，一定要有这个交换！
家园 同感 孔子后裔要搞基因库，孔家分裂鸟，谁知祖宗那一代是抱养滴或是借种来滴。纯属孔麻子贴膏药
家园 Which company? 如今有个很有意思的花钱去处，你只要寄一百刀给美国的一个什么公司，并附上血样，他就可以给你一条你的祖宗迁徙线路图。家园 迁徙的问题 做个广告。
- 复 迁徙的问题
家园 老兄写的好文 但问题未解 我从七百万年的非洲人流览到雨后，写得真好，但走出非洲后基因是如何变化的？如何确定？还有我在上文提到的问题，老兄能否帮个忙。
又：能到我这砂锅斋当个头领否，诚心诚意相邀。
家园 那就需要专门写科普文章了 河里面有人干这个的，看看他们愿不愿意写点。
简单的讲呢，DNA复制的时候，总是会出点错误的。对于个体这个错误不是必然的，但是对于一个族群，在比较长的时间内，复制错误就是必然的了。
这个错误就是变异。而这个变异还是可以继承的，有了这个变异的，其后代基本上也会带有这个特征，除非再在同一个位置上出现了另外的变异。
有了变异特征的人群在进行迁徙，这些特征也就分布开来，于是呢，年头久远了，不同的人群就会出现有自己特征的DNA特征。跟踪这些特征的变化，利用统计学方法，就可以判定这个人群与其他人群的关系，进而判断出迁徙的可能途径。
我河里面欠账太多（大约签了三四个大系列，够写一年的），怕照顾不到。老马丁那里我挂个位置还一点事情都没做呢。
谢谢了，等我有时间的时候再看看。
家园 谢谢
- 复 迁徙的问题
家园 del