五千年(敝帚自珍)

主题:【原创】南乡子- 留美生物博后 -- 把酒酹青天

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  • 家园 【原创】南乡子- 留美生物博后

    [SIZE=3]卅载读书郎,随波逐流落他乡,最是不该学生物,真忙,娇贵细胞天天养。

    前途莫论量,终身教授梦一场,金融海啸冲击下,迷茫,愿去还留鬓又霜。[/SIZE]

    打油词一首大家看个乐呵,谢各位河里的兄弟姐妹们捧个人场。

    • 家园 河里的生物wsn们,有回国找工的吗?

      给介绍下国内行情吧

    • 家园 最近刚发现对门曾经老碰见的一个博后已经是北大副教授了

      做的还是计算生物学——我觉得特别没用的东西

      • 家园 为什么是特别没有用的东西?

        想听听您的高见。

        • 家园 个人的偏见而已,经不起推敲的
          • 家园 不是想抬杠,

            是有感而發。

            我也覺得做計算要靠近第一線的實驗生物學家。因此盡管感覺很tough,我還是堅持留在做wet lab的實驗室里做計算。為的就是了解客戶需求嘛:) 我想,不管采用什么方法,給出一個推理或預測,一定要能接受檢驗,尤其是實驗的檢驗。

            • 家园 同意你的看法

              其实如果计算手段的掌握者认真了解一下生物学的问题,可以做的有意义工作是很多的。可惜问题和有解决问题能力的人经查碰不到一起去,所以不少聪明才智都浪费在为了解决问题而制造问题上去了,我的偏见基本上就指的这个,呵呵。

              • 家园 其实MD还是比较接近实验的

                不过涅,里面又有细分。anyway,这东西最好是生物背景的人来做。

                • 家园 MD是啥?

                  不過,我覺得不用把生物學與計算對立起來。

                  我個人的主張是,

                  首先我是一個科學家,

                  其次我提出的問題是生物學問題,

                  之后才是我回答問題的方法。

                  一般而言,實驗計算在研究手段上是辯證的關系。最關鍵的還是看你能提出什么樣的好問題。

                  • 家园 打酱油的路过哈

                    首先我是一個科學家,

                    其次我提出的問題是生物學問題,

                    之后才是我回答問題的方法。

                    最關鍵的還是看你能提出什么樣的好問題。

                    同意一半。蓝字部分。

                    剩下的部分有不同的理解。

                    你提出来的问题,能够利用现有的手段解决掉或者引导产生新手段来解决的问题,才是好问题。也就是说,你在提出问题的时候,如何解决这个问题,本身就是问题的一部分。也是衡量你这个问题好坏的一部分。

                    以上,仅限于生物学领域,对于数学/物理学,以及其他领域的特例,不予评论。

                    • 家园 還是要辯證地來看

                      以新問題促方法革新也是常有的,

                      小的例子比如chromatin IP方法。這個方法還是基于一般生物化學原理。但是,如果沒有提出問題,這樣的方法組合也是沒有的。

                      尤其是數學/物理方法引入生物學研究。比如我們就是想要看到活細胞中蛋白的樣子,現有的方法的確沒辦法做到。這就要求我們在方法論的原理上有所突破,不能再局限于過去的X光衍射的方法看蛋白結構,熒光標記方法看空間位置了。因此才會在未來產生一個全新的技術突破(很想講出來,可惜現在還不能)。

                      我剛進入現在這個實驗室的時候,從老板到學生都懷疑我是否能對他們的研究有所貢獻。現在這個情況就好多了,因為我通過計算做出了幾個predictions分別得到實驗的驗證,而這種prediction是很難通過一般實驗生物學做出的。

                      我覺得成功的關鍵在于不斷與實驗者溝通,并且認真思考生物學問題的本質是什么,使方法不僅緊貼實際,同時還能夠深入生命現象的本質。也算是一個問題促進方法的例子吧。

                      當然,前提是我們要提出的問題是科學問題,而非哲學問題。

                      • 家园 活细胞里蛋白的样子

                        其实也已经可以看到了

                        最近nature发了两篇,在活细胞里的NMR结构解析:Nature 458, pages 37-38。

                        这个技术已经搞了有几年,在其他刊物上也有些综述啊什么的。

                        • 家园 多謝,

                          不過我說的還不是這個。是更先進一些的東西,關鍵詞:高時空分辨,原子位置信息,無標記,活體。

                      • 家园 其實我們說得是同一回事

                        只不過視點不同而已。

                        你是從計算生物學的觀點入手,我是從實驗驗證的角度入手。只不過,生物學界裡面,大多數時間是大家都是問題一堆,在等待方法而已。

                        而計算生物學的意義,在我看來,更在於對生物領域觀念上的轉變。

                        我覺得成功的關鍵在于不斷與實驗者溝通,并且認真思考生物學問題的本質是什么,使方法不僅緊貼實際,同時還能夠深入生命現象的本質。也算是一個問題促進方法的例子吧

                        當然,前提是我們要提出的問題是科學問題,而非哲學問題

                        我就是槓子頭,所以,還是只同意一半。

                        黨科學問題對於所有的領域都有意義的時候,就不再是單純的科學問題,而是哲學問題了。比如說,達爾文的進化論。而所有科學問題的終極目的,也是哲學層次上的。這也是為甚麼要給一個哲學博士學位,而不是科學博士學位。

                        • 家园 哈哈,哲學問題

                          是我們經常拿來取笑別人說的空話和大話。比如說,“老板又在討論哲學問題了”..

                          但我本人并不排斥真正的科學哲學問題。比如,我的一個“哲學問題”是,個體的衰老(aging)到底是種群進化中的適應結果,還是只是作為耗散系統的個體中熵持續增加所致的不可逆結果。

                          聽上去好像真的很哲學,但是在具體研究中帶著這個問題,就會有很多有意思的發現。

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