主题：【原创】南乡子- 留美生物博后 -- 把酒酹青天
家园 【原创】南乡子- 留美生物博后 [SIZE=3]卅载读书郎，随波逐流落他乡，最是不该学生物，真忙，娇贵细胞天天养。
前途莫论量，终身教授梦一场，金融海啸冲击下，迷茫，愿去还留鬓又霜。[/SIZE]
打油词一首大家看个乐呵，谢各位河里的兄弟姐妹们捧个人场。
家园 河里的生物wsn们，有回国找工的吗？ 给介绍下国内行情吧
家园 最近刚发现对门曾经老碰见的一个博后已经是北大副教授了 做的还是计算生物学——我觉得特别没用的东西
家园 为什么是特别没有用的东西？ 想听听您的高见。
家园 个人的偏见而已，经不起推敲的 家园 不是想抬杠， 是有感而發。
我也覺得做計算要靠近第一線的實驗生物學家。因此盡管感覺很tough，我還是堅持留在做wet lab的實驗室里做計算。為的就是了解客戶需求嘛:) 我想，不管采用什么方法，給出一個推理或預測，一定要能接受檢驗，尤其是實驗的檢驗。
- 复 不是想抬杠，
家园 同意你的看法 其实如果计算手段的掌握者认真了解一下生物学的问题，可以做的有意义工作是很多的。可惜问题和有解决问题能力的人经查碰不到一起去，所以不少聪明才智都浪费在为了解决问题而制造问题上去了，我的偏见基本上就指的这个，呵呵。
- 复 同意你的看法
家园 其实MD还是比较接近实验的 不过涅，里面又有细分。anyway，这东西最好是生物背景的人来做。
家园 MD是啥？ 不過，我覺得不用把生物學與計算對立起來。
我個人的主張是，
首先我是一個科學家，
其次我提出的問題是生物學問題，
之后才是我回答問題的方法。
一般而言，實驗與計算在研究手段上是辯證的關系。最關鍵的還是看你能提出什么樣的好問題。
- 复 MD是啥？
家园 打酱油的路过哈 首先我是一個科學家，其次我提出的問題是生物學問題，
之后才是我回答問題的方法。
最關鍵的還是看你能提出什么樣的好問題。
同意一半。蓝字部分。
剩下的部分有不同的理解。
你提出来的问题，能够利用现有的手段解决掉或者引导产生新手段来解决的问题，才是好问题。也就是说，你在提出问题的时候，如何解决这个问题，本身就是问题的一部分。也是衡量你这个问题好坏的一部分。
以上，仅限于生物学领域，对于数学/物理学，以及其他领域的特例，不予评论。
- 复 打酱油的路过哈
家园 還是要辯證地來看 以新問題促方法革新也是常有的，
小的例子比如chromatin IP方法。這個方法還是基于一般生物化學原理。但是，如果沒有提出問題，這樣的方法組合也是沒有的。
尤其是數學/物理方法引入生物學研究。比如我們就是想要看到活細胞中蛋白的樣子，現有的方法的確沒辦法做到。這就要求我們在方法論的原理上有所突破，不能再局限于過去的X光衍射的方法看蛋白結構，熒光標記方法看空間位置了。因此才會在未來產生一個全新的技術突破（很想講出來，可惜現在還不能
）。我剛進入現在這個實驗室的時候，從老板到學生都懷疑我是否能對他們的研究有所貢獻。現在這個情況就好多了，因為我通過計算做出了幾個predictions分別得到實驗的驗證，而這種prediction是很難通過一般實驗生物學做出的。
我覺得成功的關鍵在于不斷與實驗者溝通，并且認真思考生物學問題的本質是什么，使方法不僅緊貼實際，同時還能夠深入生命現象的本質。也算是一個問題促進方法的例子吧。
當然，前提是我們要提出的問題是科學問題，而非哲學問題。
- 复 還是要辯證地來看
家园 活细胞里蛋白的样子 其实也已经可以看到了
最近nature发了两篇，在活细胞里的NMR结构解析：Nature 458, pages 37-38。
这个技术已经搞了有几年，在其他刊物上也有些综述啊什么的。
家园 多謝， 不過我說的還不是這個。是更先進一些的東西，關鍵詞：高時空分辨，原子位置信息，無標記，活體。
- 复 還是要辯證地來看
家园 其實我們說得是同一回事 只不過視點不同而已。
你是從計算生物學的觀點入手，我是從實驗驗證的角度入手。只不過，生物學界裡面，大多數時間是大家都是問題一堆，在等待方法而已。
而計算生物學的意義，在我看來，更在於對生物領域觀念上的轉變。
我覺得成功的關鍵在于不斷與實驗者溝通，并且認真思考生物學問題的本質是什么，使方法不僅緊貼實際，同時還能夠深入生命現象的本質。也算是一個問題促進方法的例子吧。當然，前提是我們要提出的問題是科學問題，而非哲學問題
我就是槓子頭，所以，還是只同意一半。
黨科學問題對於所有的領域都有意義的時候，就不再是單純的科學問題，而是哲學問題了。比如說，達爾文的進化論。而所有科學問題的終極目的，也是哲學層次上的。這也是為甚麼要給一個哲學博士學位，而不是科學博士學位。
家园 哈哈，哲學問題 是我們經常拿來取笑別人說的空話和大話
。比如說，“老板又在討論哲學問題了”..但我本人并不排斥真正的科學哲學問題。比如，我的一個“哲學問題”是，個體的衰老（aging）到底是種群進化中的適應結果，還是只是作為耗散系統的個體中熵持續增加所致的不可逆結果。
聽上去好像真的很哲學，但是在具體研究中帶著這個問題，就會有很多有意思的發現。