五千年(敝帚自珍)

主题:转基因玉米导致养猪场猪绝育 -- 唵啊吽

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      • 家园 rna剪切需要酶引导啊。没有那种酶,rna怎么切

        taq酶?我忘了

      • 家园 这个问题当然没人回答

        因为可变剪切剪切的是mRNA。

        你连基本知识都没有,还去提问题,怎么会有人理你。

        • 家园 是吗?

          可变剪切(或选择性剪切)是一个过程,即主要基因或者mRNA前体转录所产生的RNA的外显子以多种方式通过RNA剪切进行重连。由此产生的不同的mRNA可能被翻译成不同的蛋白质构体,因此,一个基因可能编码多种蛋白质。

          以上是百度百科来的

          [url=]http://baike.baidu.com/link?url=1hdHL-u1c6J-gV3pNh4HtQko_X-pCT3nn2-bgjaDK5-XoTIasyU3YyyLNpHeMdAnzsAdikY92KjaTW56GNkXkK

          [/url]

          注意,我标黑的主要基因几个字

          • 家园 看来您还得补习语文

            主谓宾,定状补。

            • 家园 你想说什么就直说

              你对那句话怎么理解的,你直说就行了,别绕

              • 家园 好嘞

                可变剪切(或选择性剪切)是一个过程,即主要基因或者mRNA前体转录所产生的RNA的【外显子】以多种方式通过RNA剪切进行重连。由此产生的不同的mRNA可能被翻译成不同的蛋白质构体,因此,一个基因可能编码多种蛋白质。

                方括号内为主语,粗体为直接修饰主语的定语。

                • 好嘞
                  家园 那我想请问“主要基因”与“mRNA前体”是什么逻辑关系?

                  我认为是并列关系

                  也就是说第一句话可以理解为主要基因转录产生的mRNA 或mRNA前体转录产生的mRNA以多种方式被RNA 剪切进行重连。

                  当然第一句话也可以理解为主要基因被RNA剪切进行重连或者mRNA前体转录产生的mRNA以多种方式被RNA 剪切进行重连。

                  不管是哪一种理解,主要基因(DNA链是吧)或其转录产物在可变剪切机制中就可以被RNA 剪切进行重连。

                  现在的问题在于,你确定原核生物中转过来的DNA 或者其转录而成的mRNA 不会被RNA 剪切而重连吗?

                  • 家园 唉……

                    也就是说第一句话可以理解为主要基因转录产生的mRNA 或mRNA前体转录产生的mRNA以多种方式被RNA 剪切进行重连

                    不管是哪一种理解,主要基因(DNA链是吧)或其转录产物在可变剪切机制中就可以被RNA 剪切进行重连。

                    这两句话一样吗?

                    点看全图

                    外链图片需谨慎,可能会被源头改

                    第一个的理解是正确的。

                    PS:那个百度百科的链接不正确

                    你再看看维基的定义

                    http://zh.wikipedia.org/wiki/選擇性剪接

                    选择性剪接(英语:Alternative splicing;又称“可变剪接”)是基因表达的方式,在人类细胞是非常普遍的。真核细胞的基因序列中,包含了内含子(intron)与外显子(exon),两者交互穿插。其中内含子在基因转录成mRNA前体后会被RNA剪接体移除,剩下的外显子才是能够存在于成熟mRNA(之后再进一步翻译成蛋白质)的片段。

                    而选择性剪接便是利用这样的特性,一条未经剪接的RNA,含有的多种外显子被剪成的不同组合,可翻译出不同的蛋白质。就能将同一基因中的外显子以不同的组合方式来表现,使一个基因在不同时间、不同环境中能够制造出不同的蛋白质(基因表达调控),可增加生理状况下系统的复杂性或适应性。

                    所以,你一开始那个很不专业的问题很好回答:转基因转进去的都是外显子,没有内含子,可变剪切在此基因处无效。

                    • 家园 我想请问你怎么确定转基因没有转进去内含子呢?

                      内含子难道不是与外显子连接在一起,甚至是穿插在一起的,而是内含子,外显子泾渭分明?

                      如果内含子外显子连接在一起,甚至是交错在一起,请问转基因怎么做到只转入外显子呢?

                      是什么决定了一段基因是内含子还是外显子呢?---难道是内含子和外显子有着明显不同的物理特征?

                      还是一段基因被表达与否决定了该段基因是内含子还是外显子子,即生物内部的某种机制决定了哪些基因是内含子还是外显子,你清楚这种机制吗?

                      • 家园 关于内含子

                        内含子剪切是发生在信使RNA(mRNA)水平的事件,所以多影响下游事件,如以mRNA的修饰和稳定性,mRNA为模版的蛋白质表达和其相应功能的发挥;一般不会对mRNA上游的事件(mRNA转录和基因组DNA的稳定)造成影响。

                        关于你提的几个问题:

                        1)内含子和外显子是在基因的DNA的序列中“穿插”排列的。

                        内含子粗分为自剪切内含子和需要辅助才能剪切的内含子两大类。

                        一部分需要辅助才能剪切的内含子存在与外显子“泾渭分明”的情况,即内含子和外显子交界处具有一些特殊的DNA序列,可以被参与内含子剪切的酶体特异性识别,而发生内含子剪切。其余的需辅助剪切的内含子主要编码tRNA,也需要特定的酶识别才能进行。

                        对于自剪切的内含子,要求内含子部分能够形成特定的分子结构。编码蛋白质的序列很难形成这样的结构,就如同我们把中文小说上的一段话拿出来变成拼音,正好能变成一首英文诗一样。所以转cDNA(见下)导致内含子剪切发生的几率是非常低的。

                        2)基因工程操作(科研和应用)中所“转”的基因序列绝大部分都是不含有内含子的cDNA序列(除了做内含子研究或者非要给自己找麻烦的人)。cDNA序列是由成熟的mRNA(经过了内含子剪切、加5’帽子和3'尾巴之后)反转录来的DNA序列,直接对应于表达蛋白的氨基酸序列,是不含有内含子的。

                        3)这个问题不太好回答。现在从实验上,我们可以先通过对解读成熟mRNA和cDNA的序列获知外显子的信息,然后将这些外显子序列放回到基因组DNA序列中去,把一个基因的外显子之间的部分称为内含子区。如果只知道DNA序列没有mRNA的信息,我们只能通过已有的经验进行一些预测,比如上面所说的“泾渭分明”的序列,一些能够造成自剪切的序列结构等等。但预测的结果还是需要实验验证的,也曾在一些内含子区中发现新基因的情况。但我们现在不知道是什么决定了内含子和外显子。

                        “物理特征”这个概念在生物中不常用,不知道你所指的具体是什么。

                        4)基因的表达与否受多种因素调控,一个基因即使在整个细胞周期中不表达,也还是被称为基因的。

                        我们常说的基因由内含子、外显子和一些调控原件组成,所以内含子和外显子是基因之下的概念,不存在哪些基因是内含子或外显子,以及相应机制的问题。

                        基因的表达是指包含所有内含子和外显子的整个区域被转录为mRNA前体,这个转录过程不会中止在某个具体位置的内含子或外显子,而是受控完成完整的转录后,中止于整个基因编码区的结束位置。

                        候教方家

                        关键词(Tags): #内含子 外显子通宝推:桥上,
                        • 家园 内含子外显子是否以i**nfor***ma**tion

                          这样的方式穿插?

                          如果是以这样的方式来穿插的话,那么显然无法做到完全的提出内含子,因此可变剪切就无法避免。

                          现在从实验上,我们可以先通过对解读成熟mRNA和cDNA的序列获知外显子的信息,然后将这些外显子序列放回到基因组DNA序列中去,把一个基因的外显子之间的部分称为内含子区。如果只知道DNA序列没有mRNA的信息,我们只能通过已有的经验进行一些预测,比如上面所说的“泾渭分明”的序列,一些能够造成自剪切的序列结构等等。但预测的结果还是需要实验验证的,也曾在一些内含子区中发现新基因的情况。但我们现在不知道是什么决定了内含子和外显子。

                          也就是说人们只能从实验得到,什么时候某基因包含了内含子什么时候某基因不包含内含子,但是只要在内含子区存在新的人们所不了解的新基因,那么人们也就无法事先知道内含子的存在,因此也就可能发生可变剪切。

                          要避免转过来的外源基因中包含着可能被剪切的内含子,就需要公布各种实验结果,让全球的学者进行研究,但是显然利益集团不肯这么做,因为这意味着这确认了转基因很可能是不安全的。

                          • 家园 你提的这几个问题

                            内含子外显子是否以i**nfor***ma**tion这样的方式穿插?

                            不确定你的例子中每个字母和*所代表的意义。

                            基因编码区一般可以这样表示:

                            5'-上游序列 --转录起始区--(外显子+内含子+外显子+内含子+************+外显子)--转录中止区

                            如果是以这样的方式来穿插的话,那么显然无法做到完全的提出内含子,因此可变剪切就无法避免。

                            没看懂

                            也就是说人们只能从实验得到,什么时候某基因包含了内含子什么时候某基因不包含内含子,

                            我们一般所说的基因指DNA序列。通过实验可以知道基因内内含子的有无、位置和序列信息,但这些信息和时间无关。基因的DNA序列是相对稳定的,不会有时候有,有时候没有内含子。

                            但是只要在内含子区存在新的人们所不了解的新基因,那么人们也就无法事先知道内含子的存在,因此也就可能发生可变剪切。

                            某基因的内含子区可能存在新基因,但人们至少知道这个内含子区是在该某基因内的。

                            如果你说的是新基因内存在新基因的内含子,那么其一,这个概率是非常低的;其二,这个新基因应该具有普通基因的一般特征,也可以被一般的实验方法所研究。

                            要避免转过来的外源基因中包含着可能被剪切的内含子

                            绝大多数情况下转基因所“转”的都是不含有内含子的cDNA序列,所以一般不含有可以被剪切的内含子。请参考我的前一个回复。

                            关键词(Tags): #内含子
                            • 家园 字母代表外显子的碱基,*代表内含子的碱基

                              一个碱基序列i**nfor***ma**tion,你只要外显子,剔除内含子就很困难

                              我们一般所说的基因指DNA序列。通过实验可以知道基因内内含子的有无、位置和序列信息,但这些信息和时间无关。基因的DNA序列是相对稳定的,不会有时候有,有时候没有内含子。

                              由于一个基因表达多种蛋白,假设其表达A,B这两种蛋白

                              它表达A蛋白的时候,相对应的碱基序列与表达B蛋白的时候的碱基序列不同,因此可以认为表达不同的蛋白的时候的外显子不同,因而内含子也因此不同

                              当然也存在着在表达A,B两种蛋白的时候,外显子,内含子相同,仅仅是因为对外显子的剪切所导致的不同的结果---即内含子相同但是剪切方式不同导致

                              根据曹明华的文章,人们已经发现某种植物(貌似是水稻)的一个基因可以表达几万种蛋白,难道是剪切点的不同导致有那么大的差异,而不是因为在表达某些蛋白的时候,某些碱基序列是作为内含子,而在表达某些蛋白的时候,某些碱基序列是作为外显子?

                              绝大多数情况下转基因所“转”的都是不含有内含子的cDNA序列

                              不懂为什么cDNA序列就不包含内含子,另外转入不包含内含子序列的基因序列对于原来的包含有内含子的真核生物的基因序列的稳定性是否会产生影响?

                              • 家园 又是5个问题

                                1)

                                一个碱基序列i**nfor***ma**tion,你只要外显子,剔除内含子就很困难

                                还是不大懂你的意思。

                                “要”外显子意味着已经知道了外显子序列信息吗?

                                如果知道了,现在有各种方法可以获得只含有外显子的序列,最直接的就是化学合成所需的DNA或RNA序列。

                                如果不知道,一般采用先“钓取”该基因的mRNA,然后反转录cDNA的方法获得外显子的信息。成熟的mRNA只含有外显子直接指导蛋白质的合成,故成熟mRNA和以其为模版反转录的cDNA对应于外显子,不含有内含子。

                                2)

                                由于一个基因表达多种蛋白,假设其表达A,B这两种蛋白

                                它表达A蛋白的时候,相对应的碱基序列与表达B蛋白的时候的碱基序列不同,因此可以认为表达不同的蛋白的时候的外显子不同,因而内含子也因此不同

                                当然也存在着在表达A,B两种蛋白的时候,外显子,内含子相同,仅仅是因为对外显子的剪切所导致的不同的结果---即内含子相同但是剪切方式不同导致

                                表达的蛋白的氨基酸序列只对应于外显子(否则,内含子也就不叫内含子了)。如果一个基因通过可变剪切表达两种蛋白A和B,则其外显子的表达方式不同。从蛋白水平看不到内含子的变化(无论A与B,所有的内含子都切除了),所以不存在“内含子相同或不同”的问题。

                                3)

                                根据曹明华的文章,人们已经发现某种植物(貌似是水稻)的一个基因可以表达几万种蛋白,难道是剪切点的不同导致有那么大的差异,而不是因为在表达某些蛋白的时候,某些碱基序列是作为内含子,而在表达某些蛋白的时候,某些碱基序列是作为外显子?

                                曹的文章没有看过。如果是严肃的科研文章,欢迎提供索引信息,我有兴趣读一读。如果是没有实验数据的评论或者科普文章,我就不做评论了。

                                4)

                                不懂为什么cDNA序列就不包含内含子

                                可以参考1)的回答和维基百科

                                http://en.wikipedia.org/wiki/Complementary_DNA

                                5)

                                另外转入不包含内含子序列的基因序列对于原来的包含有内含子的真核生物的基因序列的稳定性是否会产生影响?

                                我只能说有这个可能,这也是对基因工程和操作进行研究的重要原因之一,但这个影响多数情况下很小。

                                现在科研中对高等真核生物基因组进行人工改造都是一件不大容易的事情,需要多种因素的共同作用。今年才刚刚有了一个突破性的进展,出现了能够较为有效和简单的操作手段。因此,由于转入一个以表达为目的的不含内含子序列的基因,造成真核生物基因组变异的概率是非常低的。

                                • 家园 关于一个基因万种蛋白的曹明华没有给出文献

                                  同时她也认为可变剪切与转BT产品无关

                                  大多数基因都不只编码一个蛋白质,有些基因可以产生许多、许多不同的蛋白质,比如果蝇, 它的一个基因可以产生 (38016) 个不同的蛋白质分子。

                                  这部分她没有列举出文献

                                  但是下面的一段她给出了文献来源

                                  【顺便提一下,即便与“可变剪接 Alternative Splicing”的原理无关的原核生物转基因 --- Bt转入的玉米 --- 据加拿大食品检测机构 (Canadian Food Inspection Agency) 报告: Bt-11 玉米居然被发现产生四(4)种不同的 Bt 蛋白。这不能不引起消费者们忧心重重。(请见所附参考资料 9)】。

                                  9. Syngenta’s GM Maize Scandals: A trail of unstable GM maize varieties, dead cows, cross-contamination and misinformation.” ISIS Press Release, March 30, 2005.

                                  外链出处

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