五千年(敝帚自珍)

主题:从上海“中润十三阳性”说起…… -- 普鲁托

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  • 家园 从上海“中润十三阳性”说起……

    先来两个趣味小问答。

    第一:

    一个城市开展灭鼠运动。

    政府提出的措施是,市民逮住一只老鼠,可获得政府100元奖金。问:半年后城市里的老鼠数量会发生什么变化?

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    一种可能是,老鼠真的会减少;

    另一种可能是,大家会私下养老鼠😄🤭

    第二:

    这个和新冠有关。

    测核酸,因为要扩增等技术处理,一般需要等几个小时才会有结果。

    假如现在有某个原因催得急,你不得不在真正的实验室结果出来之前拿出报告。那么,问:你会报阳性还是阴性?

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    最近俺外出,做了好几轮核酸检测,无论是在各高速路口还是城市社区,体验怪怪的。

    查了一下今年1月国家卫健委发的核酸检测操作指南,咽拭子采集部位是在扁桃体、咽后壁。

    这是一个会让人恶心的操作,部分人还需要用压舌板把舌头给摁住才能采集。

    在这里,想问问各位(担任过志愿者的和被采集核酸过的),体验如何?

    ——————————————--正题分界线—————————————-

    自从全球被新冠病毒暴虐后,核酸检测成了热题。

    抗疫决策需要数据——真实/接近真实的数据。核酸检测成了数据来源的重中之重。

    PCR(polymerase chain reaction)——聚合酶链式反应技术是当前检测病毒核酸的主要手段。这项技术的发明者,美国诺奖获得者、化学家凯利-穆利斯已于2019年8月7日死于肺炎。

    点看全图

    那个年代的肺炎基本不死人,而且还是在非流感季节(这里可以有阴谋论)。

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    人类得上感染性疾病,首先要做的就是找病原体——寄生虫、细菌、病毒……

    —寄生虫🪱很大,蛔虫……肉眼可见,太可怕了。

    —细菌,看不见。最常见的办法就是采集可能的细菌源(脓液、血液、尿液……)扔到牛肉汤里培养,培养出一大堆,然后用显微镜来观察其特点……染色分类、识别……也许有人会问,找到一个细菌就完了呗,干嘛要培养一大堆出来,多危险⚠️

    【这里需要注意一个问题,医学不是物理学,更不是数学,远不是一是一、二是二的问题。病原学诊断规定,必须在培养皿上看到(此处是举例)三个菌落、在一个视野下数出20个细菌,才作数。这更像是统计学?是的,医学很大程度上就是统计学。这么做,没有别的更大的原因,就是因为这么做——实践有效!!——目前还没找到更有效的办法……】

    —病毒,更看不见。也可以采用类似细菌的办法。

    总的来说,这些办法都比较慢、比较“笨”。

    自从有了凯利-穆利斯,病原学进入了基因时代。

    PCR技术是怎么查找细菌、病毒的呢?拿新冠病毒举例……

    前提:已测出新冠病毒基因序列,不论是阿尔法、德尔塔、奥密克戎……找出其特征片段,作为对比的诊断标准。

    咽拭子采集,如同一道彩虹🌈划过咽后壁黏膜组织。有的咽拭子很厉害,绵头上带有细微的“钢丝刷”,不无痛苦的带走一片云彩……🥱🥱

    采集下来的组织中含有某种病毒的基因片段【注意,只需要基因片段,并非一定要活病毒】,接下来,拿回实验室扩增。

    怎么扩增?这是PCR技术的关键。靠的是天才凯利-穆利斯在一个秋天的下午带女漂回家路上的灵光乍现🤗

    DNA是双螺旋结构。打开后是两条链,并且信息互补。穆利斯发现在90摄氏度左右,双链打开,在聚合酶、“营养液”、60摄氏度等一堆“乱七八糟”的条件下,两条单链通过碱基配对,重新形成两条基因片段……如此重复操作,如同临界状态下铀原子核被中子轰击:

    点看全图

    当此操作一次,Ct值为1……操作40次,Ct值为40……如此类推。现在有的PCR仪的标准已经修订为Ct值=>35就可以出报告【修改的意义后面另说】。

    在PCR技术下暴增的基因片段,通过胶体电泳或荧光探针等技术,可以产生肉眼可见的特征图像,类似:

    点看全图

    OK,出报告。

    通宝推:敲门,西安笨老虎,冻雨,翼德,不远攸高,审度,
    • 家园 (续)从蔡阿姨家的阳性说起……

      背景:

      【市民蔡阿姨4月21日从方舱康复出院回到位于徐汇区的家里,区疾控也证实她不是“密接”,可为何25天过去了,家门上还贴着封条?

      没法出门,不能看病。这可怎么办?

      根据5月4日上海疫情发布会上的消息,从方舱出院的患者不列入社区筛查对象,在出院后第七天开展一次核酸检测。

      记者采访了解到,社区已于4月29日上门为蔡阿姨夫妻俩进行核酸检测。蔡阿姨说:“我老伴4月20号回家,我21号回家,29号复查了一次,那次说我阴性,我老伴又阳性了,这次之后就再也没消息了。

      点看全图

      那么,蔡阿姨的先生到底是不是又“阳”了?蔡阿姨算不算密接呢?

      记者拨通徐汇区疾控24小时值班电话,疾控工作人员表示,蔡阿姨老伴的Ct值为39,理论上不具有传染性,而是处于康复期,老先生不需要转运,同住人蔡阿姨也不属于密接。Ct大于35,应该可以正常就医。】

      =======背景结束========

      前面说了,在核酸检测中,基因片段复制一次,CT值为1……复制40次,CT为40。

      在新冠疫情初期,要求CT为40以上才出具阴性报告。国家卫健委在今年3月15日发出的新冠诊疗指南第九版中,将解除隔离标准修改为CT=>35,这意味着什么?

      点看全图

      先澄清两个概念:

      一、PCR测的是基因片段数量,不是病毒个数,二者不是等量关系。但是,不感染病毒,鼻咽部则肯定不会有病毒基因片段存在。二者是一个相关关系,可以理解为正相关——病毒数量越多,采集到的基因片段就会越多。

      二、感染性疾病的发生,和病原体数量有关,且存在一个阈值,各个人的阈值不尽相同(这与免疫力有关),但统计学上成正态分布。举例:大多数人100个病毒就发病,但有少数人10个或者200个才发病。

      且,如果仅2个病毒的话,所有人都不会发病【此有后话】

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      回到CT的话题。

      以前,采集到的病毒需要扩增40次才会被发现。这就是说,扩增35次时发现为“没有”。

      现在把标准修改为35次,就有可能一部分以前判断为阳性的人,现在判断为阴性。

      蔡阿姨丈夫的情况即是如此,其CT值为39:

      按旧标准,阳性;

      按新标准,阴性。

      这也可以解释,以前一些海外人员拿着阴性报告回国,再检测却是阳性……

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      新版指南为什么要这么改?国际接轨?

      理论上认为,CT值35以上,感染者不具有传染性:

      1、前面有举例,2个病毒,所有人都不发病。

      2、CT值35以上的感染者,呼出空气中含有的病毒数<=2

      通宝推:光头佬,审度,
    • 匿名 我倾向于应当取消资质。

      第一,他是个检测企业,质控失效,检测无意义。

      第二,从检测角度来讲,至少他得有阴性和阳性对照。这还是质控部分。

      第三,即使要的急,检测实时曲线还是看得出来的。除非是刚放上,否则基本是瞎编胡说,赌概率。这与济南那家犯事操作一个路子。

      通宝推:菜根谭,
    • 家园 另一种可能几乎必然会出现

      另一种可能是,大家会私下养老鼠😄🤭

      取决于养老鼠的成本,如果远低于100块一只,必然会出现,如果99块一只,加上惩罚措施,估计就没啥人干了。

    • 家园 恨不得宝推两次

      普大夫很少写专业贴😁

    • 家园 挑个小毛病,这个观点是不准确的

      那个年代的肺炎基本不死人,而且还是在非流感季节(这里可以有阴谋论)。

      在疫情以外的正常年代,不论是国内、国外,死于基础疾病、肿瘤的病人,多数是经过肺炎,由肺炎引起呼吸衰竭导致多脏器衰竭死亡的,但死亡报告通常只提基础疾病死亡。这个过程统称急性呼吸窘迫综合症(ARDS),肺炎和脓毒血症(败血症)是引起ARDS的主要风险因素。非典和新冠病毒是可以引起ARDS的新发现风险因素。

      世界范围内,肺炎是临床死因的一个主要因素。家中由基础疾病或肿瘤的老人,最怕的就是病毒或细菌引起的肺炎,或非特异性肺炎,出现了就是凶多吉少。

      通宝推:假设,冬晓,
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